阜阳铁路、公路、航空、水运相互衔接的立体交通网正在建设。境内已建成运行的有界阜蚌、合淮阜、阜亳、阜周高速公路、阜新高速公路。境内的淮河、沙颍河是通往华东的水运航道。
2016年，阜阳全年公路货物运输总量4.3亿吨，比2015年比上年增长7.0%；旅客运输总量0.8亿人次，比2015年下降9.8%。公路货物运输周转量1135.5亿吨公里，比2015年增长3.9%；旅客运输周转量54.4亿人公里，比2015年下降15.1%。港口货物吞吐量1195.3万吨，比2015年下降14.1%。皖北唯一的4C级民航机场阜阳机场航线10条，民航旅客吞吐量45.8万人次，比2015年增长2.6%。
2016年年末，阜阳民用汽车拥有量62.4万辆，比2015年增长13.6%。其中，私人汽车51.2万辆，比2015年增长17.1%。
铁路
【阜阳铁路枢纽】
商阜、濉阜、漯阜、阜淮铁路在境内构成“米”字型框架，6个方向的铁路在此交汇。阜阳编组站日编组能力达1.8万辆，阜阳火车站最高峰日发送旅客达10万人。
阜阳站被誉为现代化的“农民车站”，是全国五大民工源头输出地之一。 阜阳北站是阜阳铁路枢纽的主要编组站，站场结构为三级四场（到达场、出发场、西到发场和编组场），有到发线、编解线41条，每日编解能力能达到近1.8万节。
普速铁路：京九铁路（国家干线）、阜淮铁路（地方铁路）、青阜铁路（地方铁路）、漯阜铁路（地方铁路）
城际铁路：阜宿淮徐城际铁路（规划中）、南驻阜城际铁路（规划中）、阜六城际铁路（规划中）
高速铁路：商杭高铁（建设中）、郑阜高铁（地方铁路，建设中）
火车站：阜阳站、阜阳西站、阜阳北站、阜阳西站、阜阳南站
水运
阜阳全市水运通航里程736公里，是中原通往华东的黄金水道。
阜阳港有界首、太和、颍上、临泉、阜阳等14个作业区，设计年港口吞吐能力367万吨。主要有阜阳港界首作业区、阜阳港太和作业区、阜阳港颍上作业区。共有生产性码头泊位109个，其中300吨级泊位4个；港区岸线长度4.81公里，生产用仓库2748平方米，生产用堆场77969平方米；铁路专用线2条总长7957米，其中装卸线长度1600米；全市辖区内拥有18家水运企业、3170艘运输船舶、118万吨运力。可以承接各种货船代理，豫、皖直达江、浙、沪的铁、公、水联运业务和直达闽、粤、琼的江海河联运业务。
航空
阜阳机场位于阜阳市西南部，安徽省三大民用机场之一，距阜阳市中心约9公里。是安徽省最早的三个民用机场之一，于1998年12月26日正式通航。阜阳机场飞行区按4D级标准设计，跑道长度2400米，宽度60米，停机坪4万平方米，候机楼面积7200平方米，可满足高峰每小时600人次需求。同时，航管楼配备国际先进的通信、导航设施，为全天候使用的机场，能起降波音737，麦道90等类型飞机。
公路
宁洛高速（阜阳段）南京-滁州-蚌埠-利辛-太和-周口-洛阳
济广高速（阜阳段）济南-商丘-亳州-阜阳-六安-安庆-鹰潭-瑞金-广州
滁新高速（阜阳段）滁州-定远-淮南-阜阳（阜南三塔）-临泉南-新蔡
阜淮高速（阜阳段）阜阳-阜南-淮滨（2017年开建-2019年建成）
阜徐高速（阜阳段）阜阳-涡阳-淮北-徐州（2017年开建-2019年建成）
合阜高速（阜阳段）太和-阜阳-霍邱县-合肥市（2016年开建-2019年建成）
界阜高速（阜阳段）界首-临泉-阜南-颍上-固始（规划中，预计2018年）
沿淮高速（阜阳段）淮滨--阜南-颍上-淮南（规划中，预计2018年）
未来该市境内将新增两横一纵三条国道。纵向国道G220，横向国道G329、G345